虽然都是马自达在国内的合资公司，但是长安马自达是长安、福特合作的公司，05年在南京建厂，07年的时候开始正式投产，旗下主要生产CX-3、CX-5、CX-8、马2、星骋和昂克赛拉等，而一汽马自达是一汽和马自达合资的公司，主要车型有CX-4、CX-7、老马6、阿特兹等。
一马因为CX-4上市大卖，把睿翼生产线停止，全力支持CX-4和阿特兹，而长马的好评口碑以及销量都超过一马，特别是昂克赛拉，撑起了长马的一片天，而CX-5其实也很好，只是有点贵，比同级别贵2万左右，但是质量绝对非常好，性价比很高。
除了厂商和车型不同外，其零部件也是有区别的，长安马自达在国内有生产线，总部在南京，它最开始发动机也是日本进口、变速箱泰国制造、底盘车架是南京生产线冲压焊接的，但是后来慢慢掌握核心技术，并能够稳定生产合格产品后，现在长马所有批次的车型都是国产的，除了CX-3是进口的。
而一汽马自达，总部在吉林长春，三大件在国内都没有生产线，所以三大件都是进口的，只有车架附件之类的是国产。所以有人说长马的质量不如一马，因为国产质量上还是比不上进口，但实际上长马在质量上一点问题都没有。
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