玛卡的好坏同其生长环境有着重要影响，要求高海拔（3000m以上），低氧、低纬度，气候特殊而土地肥沃，昼夜温差大。中国内地仅有云贵高原和青藏高原过渡地区具备这样的条件。目前市面最优质的玛卡皆来自丽江玉龙雪山3000米海拔处的玛咖标准化基地。不过丽江的玛卡同样也有优劣之分，其中比较好的黑玛咖都是被云南白药集团收购，并制成它们的小黑瓶玛咖片的。
